南京大学盐城环保技术与工程研究院是由南京大学和盐城市人民政府共同签约成立的自收自支事业单位，是南京大学创办的14个校外产学研合作平台之一，于2011年7月正式投入运营。
         研究院致力于环境治理技术研发与服务和环保科技成果产业化，主要研发方向是环境功能新材料的研发与应用、高浓度有机废水的治理与资源化、饮用水安全保障以及工业三废的治理与资源化。涉及环保服务研发、设计、检测评估；环保设施设计；建设与运营；环保成套装备的技术研发、设计、工程化及生产制造。
         2011年研究院被国家科技部列为“淮河流域再生水利用与风险控制产业技术创新战略联盟试点”， 被国家环保部列为“国家十一五重大专项产业技术创新战略联盟”，被江苏科技厅列为“江苏省产学研联合创新重大载体建设项目”， 团队被授予“盐城市创新创业领军人才”。2011年团队承担的国家“十一五“重大水专项的贾鲁河课题以“双优”成绩通过国家水专办验收。2013年，团队被推荐为国家“万人计划”重点领域创新团。2014年，江苏省经信委认定研究院为省三星级中小企业公共服务平台。
         南京大学盐城环保技术与工程研究院注重与地方企业和行业开展合作。近三年以来，承担国家级项目 1 项、省部级 4 项、企业合作 100 余项。在流域污染控制、区域污染控制以及饮用水安全保障等方面发挥了极其重要的作用，有力支撑了淮河流域以及江苏沿海地区社会经济可持续发展。上一年度产值 2500 多万元。